Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms