Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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