Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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