Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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