Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00612Q8N6U2 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms