Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms