Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOGA3Q5TF21 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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