Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FXNQ16595 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms