Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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