Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms