Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CNGA3Q16281 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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