Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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