Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USF2Q15853 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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