Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms