Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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