Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms