Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SCARB2Q14108 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SCARB2Q14108 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SCARB2Q14108 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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