Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CBFBQ13951 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms