Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms