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| FHL3 | Q13643 | SPATA5-201 | ENST00000274008 | 8137 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL672167.1-204 | ENST00000641875 | 3017 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC00622-201 | ENST00000562811 | 1570 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF24-202 | ENST00000399061 | 6282 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | FAM46D-202 | ENST00000538312 | 3106 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTND5P17-201 | ENST00000418405 | 1603 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC006148.1-201 | ENST00000484322 | 4310 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | ARHGEF6-203 | ENST00000370622 | 4779 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF569-203 | ENST00000392150 | 1918 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| FHL3 | Q13643 | HSFY2-202 | ENST00000344884 | 1038 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.70-201 | ENST00000362886 | 110 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| FHL3 | Q13643 | MAPK8-202 | ENST00000374174 | 739 nt | TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU6-882P-201 | ENST00000391025 | 103 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| FHL3 | Q13643 | MIR1271-201 | ENST00000408537 | 86 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU2-41P-201 | ENST00000410991 | 178 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | RPL7AP73-201 | ENST00000413490 | 353 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FHL3 | Q13643 | CHEK2P3-201 | ENST00000416118 | 248 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |