Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms