Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms