Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms