Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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SF3B2Q13435 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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