Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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