Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SNTA1Q13424 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SNTA1Q13424 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SNTA1Q13424 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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