Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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