Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CHAF1AQ13111 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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