Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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