Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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