Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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BPTFQ12830 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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BPTFQ12830 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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BPTFQ12830 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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