Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms