Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERFP50548 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERFP50548 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms