Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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