Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP18Q9UMW8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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