Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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