Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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