Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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