Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN2A2-201ENST00000352867 3241 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF215-201ENST00000278319 3448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC39A-201ENST00000262675 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIA1-201ENST00000285900 5708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAMDC2-201ENST00000377182 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX19B-201ENST00000288071 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIC3-201ENST00000309737 2859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU1-120P-201ENST00000363009 157 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RMRP-202ENST00000363046 264 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA74B-201ENST00000391100 201 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031229.1-201ENST00000404273 224 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031777.1-201ENST00000405418 499 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQCF4-204ENST00000433169 414 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CREB3L2-205ENST00000458726 776 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL724P-201ENST00000461895 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL507P-201ENST00000474076 296 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL144P-201ENST00000475761 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016968.1-201ENST00000479610 697 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091144.2-201ENST00000521717 433 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASB8-211ENST00000539528 839 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004801.5-201ENST00000552958 550 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3150B-201ENST00000580142 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPIAP1-201ENST00000587900 742 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355989.2-201ENST00000603304 512 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLS3-AS1-201ENST00000606397 521 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.155-201ENST00000616367 282 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3150A-201ENST00000636546 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms