Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SALL3Q9BXA9 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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