Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms