Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms