Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms