Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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