Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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