Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP2B3Q16720 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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