Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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