Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
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TNXAQ16473 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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TNXAQ16473 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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