Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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