Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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