Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms